在公元2015年，一个魔术尚存的最后时代之中。人理继续保障机关「Chaldea」，透过近未来观测镜「Sheba」突然发现人类即将在接下来的2016年中毁灭。为了针对异象及时空特异点进行解析及干涉，他们利用被统称为「Grand Order」的禁忌仪式，将魔术师灵子化之后送回过去，只为阻止人类历史就此中断。