2117年，未来东京，怪人二十面相与明智侦探的战斗，历经7代后仍在继续。7代目小林少年所率领的少年侦探团，也仍然适度地将惊险的动作冒险夹杂在日常当中，悠然地度过每一天。但此时某个人物“怪人二十面相”却隐藏着恐怖的阴谋……。究竟第七代小林少年与第七代明智小五郎能否阻止怪人二十面相的暴走呢？