怪怪守护神讲述平凡的高中生．加贺见一也跟自称是他的“主人”的美少女付丧神桐叶，一起过著奇妙的同居生活。但是就在某一天，一个自称是土地神菊理媛神所派来的使者，而且还是个美丽的大波霸巫女黑耀，出现在他们面前，究竟她的目的为何…一起睡觉、一起洗澡…这个一点也不像是守护神、不按牌理出牌、顽皮又可爱的桐叶，老是将一也耍得团团转，让他每天都过著这种有点不可思议的日子。